จากสถานการณ์การแพร่ระบาดของโรคติดต่อเชื้อไวรัสโควิด-19 (COVID-19) ภายในประเทศ ส่งผลกระทบถึงทุกภาคส่วน ไม่เว้นแม้แต่ภาคการศึกษา ซึ่งทางรัฐบาลต้องออก พ.ร.ก.ฉุกเฉิน พร้อมตั้งศูนย์บริหารสถานการณ์การแพร่ระบาดของโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (โควิด-19) หรือ ศบค. พร้อมออกอีกหลากหลายมาตรการเพื่อป้องกัน และควบคุมสถานการณ์การแพร่ระบาดของเชื้อไวรัสดังกล่าว

โดยทาง พระราชปริยัติกวี, ศ.ดร. อธิการบดีมหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย (มจร) ได้ออกแถลงการณ์แนวทางการบริหารงานในสถานการณ์ปัจจุบัน กำหนดแนวทางในการป้องกันการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัสโควิด-19 ไว้ 7 ประเด็นดังนี้

1. มาตรการการบริหาร ดูแลนิสิต จัดการศึกษา การเรียนการสอน การวัดผล และประเมินผล ทั้งส่วนกลางและภูมิภาค
- ให้ มจร จัดการศึกษา การเรียนการสอน การวัดผล-ประเมินผล โดยใช้ระบบออนไลน์เป็นหลัก
- สำหรับรายวิชาข้อสอบกลาง มีการเปลี่ยนแปลงกำหนดการสอบจากเดิมโดยเปลี่ยนมาใช้รูปแบบการสอบออนไลน์ทั้งหมด

2. การทำงานของบุคลากร เป็นการบริหารงานเพื่อสนับสนุนการศึกษา ทั้งส่วนกลาง และส่วนภูมิภาคแบ่งเป็น 2 ประเภท 
- ประเภทการทำงานที่สามารถทำงานที่บ้านได้ ผ่านทางออนไลน์
- ประเภทที่ต้องประจำที่สำนักงาน ให้ผู้บริหารเป็นผู้พิจารณา จัดรูปแบบการทำงานแบบเหลื่อมเวลา ให้มีผู้ดูแลสำนักงานผลัดกันไปเพื่อยึดหลัก Social Distance ตามนโยบายรัฐบาล

3. การบริหารอาคารสถานที่
ส่วนกลาง และส่วนภูมิภาค มีการฉีดน้ำยาฆ่าเชื้อ ให้ผู้บริหารระดับสูงทั้งในส่วนภูมิภาค ทั้งที่เป็นวิทยาเขต วิทยาลัยสงฆ์ ศึกษาการหาน้ำยาฆ่าเชื้ออาคารสถานที่ของมหาวิทยาลัยในส่วนที่รับผิดชอบ
- ทำให้มหาวิทยาลัยเป็นมหาวิทยาลัยสะอาด GREEN UNIVERSITY
- การเข้าออก บริเวณมหาวิทยาลัยให้มีจุดคัดกรอง วัดไข้ ดูแลความเป็นระเบียบเรียบร้อย เข้า-ออกทางเดียว ดูแลกวดขันเข้มงวดมากยิ่งขึ้น

ในส่วนประเด็นเสริมในเรื่องสุขภาพของประชาคม มจร
- บุคคลากร เจ้าหน้าที่ นิสิต ทั้งส่วนกลางและส่วนภูมิภาค ได้จัดเครื่องมือตรวจวัดไข้ เจลแอลกอฮอล์ หน้ากากอนามัย ไว้พร้อม เหตุเพราะยังมีบุคลากร เจ้าหน้าที่ และนิสิตบางส่วน ยังจำเป็นต้องใช้อาคารสถานที่ มจร อยู่ จึงต้องดูแลอย่างดีที่สุด

4. การจัดกิจกรรมโครงการต่างๆ ของมหาวิทยาลัย
- งดกิจกรรมการรวมตัวของคนกลุ่มใหญ่
- งดโครงการบรรชา และอบรมภาคฤดูร้อน
-งดจัดกิจกรรมอื่นๆ เปลี่ยนเป็นรูปแบบออนไลน์

5. โภชนาการ
- ทาง มจร มีนิสิตจากหลายชาติหลายประเทศ ที่ยังไม่สามารถเดินทางกลับประเทศตนเองได้ จึงได้มีการดูแลเรื่องโภชนาการ ไม่ว่าจะเป็นการฉันในภาชนะส่วนตัว การเว้นระยะหว่าง การใช้เจลแอลกอฮอล์

6. การตั้งศูนย์ควบคุมและป้องกันการแพร่ระบาดเชื้อไวรัสโควิด-19
- มจร ส่วนกลาง วังน้อย ได้มีการจัดตั้งศูนย์เฉพาะกิจเพื่อป้องกันการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัสโควิด-19 เนื่องจากเป็นศูนย์ใหญ่ มีคนเข้าออกจำนวนมาก จึงมีการตั้งศูนย์ควบคุมและป้องกันการแพร่ระบาดเชื้อไวรัสโควิด -19 มีการตั้งสำนักงานเป็นการเฉพาะมีเจ้าหน้าที่ประจำศูนย์ 24 ชั่วโมง มีการรวบรวมข่าวสารทั้งจากภายในและภายนอก ในเรื่องการตรวจตราคัดกรอง
- ให้ผู้บริหารระดับสูง ในส่วนภูมิภาค รองอธิการบดีวิทยาเขตในส่วนภูมิภาค ผู้อำนวยการวิทยาลัยสงฆ์ ได้ศึกษาหน้าที่การดำเนินงานของศูนย์ควบคุมดูแลที่ตั้งอยู่ในส่วนกลางเพื่อไปพิจารณาดำเนินการในส่วนภูมิภาคที่รับผิดชอบ เพื่อเป็นการป้องกันการแพร่ระบาดของโควิด-19

7. พิธีประสาทปริญญา
- ได้มีการเลื่อนพิธีประสาทปริญญาออกไปจนกว่าจะเข้าสู่สภาวะปกติ