สำหรับประเทศญี่ปุ่นที่ตอนนี้มียอดสะสม 17,146 ราย เสียชีวิตแล้ว 922 ราย  นับเป็นประเทศที่พบผู้ติดเชื้อมากที่สุดเป็นอันดับที่ 2 ของเอเชียตะวันออก ทำให้ นายกรัฐมนตรีชินโซ อาเบะประกาศยกเลิกภาวะฉุกเฉินทั่วประเทศ หลังจากที่สถานการณ์การแพร่ระบาดของโควิด-19 ภายในประเทศอยู่ในเกณฑ์ดีขึ้น

ล่าสุด(11มิ.ย.63) ทางรัฐบาลญี่ปุ่นกำลังจะอนุญาตให้ชาวต่างชาติทางเข้าประเทศอีกครั้ง แต่จำกัดวันละ 250 คน และมาจาก 4 ประเทศดังต่อไปนี้คือ ออสเตรเลีย นิวซีแลนด์ ไทย และเวียดนาม ซึ่งเบื้องต้นคนที่จะสามารถเดินทางเข้าญี่ปุ่นได้ ให้กับบุคคลเฉพาะกลุ่ม เช่น ผู้บริหาร หรือวิศวกร แต่ยังไม่อนุญาตให้นักท่องเที่ยวทั่วไปได้