วันที่ 4 พฤษภาคม 2564 นายภานุ แย้มศรี ผู้ว่าราชการ จ.พระนครศรีอยุธยา เปิดเผยว่า คณะกรรมการโรคติดต่อของจังหวัด ได้พิจารณาพร้อมลงมติ  สั่งให้ขยายวันเวลา ปิดตลาดกลางกุ้งอยุธยา เพิ่มต่อไปอีก 7 วัน  คือตั้งแต่วันที่ 5-11 พฤษภาคม 2564 นี้ สาเหตุเพราะว่า  มีการแพร่ระบาดของเชื้อโควิดในพื้นที่ และก่อนหน้านี้ได้ มีการปิดตลาดมาหลายรอบแบบต่อเนื่อง  ตั้งแต่วันที่ 17 เมษายนจนถึงวันที่ 4 พฤษภาคม 2564  โดยจากข้อมูลพบว่า ทั้งตลาดมี 10 ร้านค้าที่พบการติดเชื้อ และมีผู้ติดเชื้อจากตลาดแห่งนี้ 43 คน

โดยตลอดเวลาที่ให้ปิดตลาด ได้มีการปรับปรุงเพื่อความปลอดภัย ให้เป็นไปตามมาตรฐานของกรมควบคุมโรค โดย อบจ.พระนครศรีอยุธยา เจ้าของพื้นที่  ได้เข้าปรับปรุงด้านโครงสร้าง ระบบสาธารณูปโภค ระบบท่อระบายน้ำ และถนน ซึ่งได้ดำเนินการไปแล้ว  ส่วนเจ้าของร้านต้องปรับปรุงสภาพภายในร้านอาหารประเภทกุ้งเผาปลาเผา  ซึ่งมีเป้าหมาย 12  ร้านค้า ปรากฏว่าผ่านเกณฑ์มาตรฐานเพียง 1 ร้านค้าเท่านั้น อีก 11 ร้านค้าไม่ผ่าน  โดยประเด็นที่ตรวจไม่ผ่านเกณฑ์ ได้แก่ ระบบการควบคุมลูกค้า ระบบระบายอากาศ ระบบบ่อดักไขมัน ซึ่งทั้งหมดต้องปรับปรุงต่อไป จนกว่าจะผ่านเกณฑ์มาตรฐาน