เมื่อวันที่ 22 พ.ค. 64  มีรายรายงานงานว่า คณะแพทย์จากหลายสถาบันและนักวิทยาศาสตร์ 9 คน ออกรายงานสำหรับประชาคมวิทยาศาสตร์ เรื่องการระบาดในประเทศของเชื้อ สายตระกูล B.1.351 (20H/501Y.V2) หรือโควิดสายพันธุ์แอฟริกา  รายงานดังกล่าวเขียนว่าทางกลุ่มพันธมิตร COVID-19 Network Invesigations (CONI) ได้รับการประสานจากทางกระทรวงสาธารณสุขให้ร่วมสืบสวนคลัสเตอร์ ที่อำเภอตากใบ จังหวัดนราธิวาส โดยได้รับข้อมูลว่าอาจเป็นคสัสเตอร์ติดเชื้อต่อเนื่องในบระเทศไทย จากผู้ลักลอบเข้าเมือง  ล่าสุดได้รายงานผลการตรวจสอบพบว่า เป็นสายพันธุ์แอฟริกาใต้

ทั้งนี้ทางกลุ่มขอสื่อสารข้อมูลชุดนี้ให้ประชาคมวิทยาศาสตร์เพื่อร่วมกัน ติดตาม เฝ้าระวัง และพัฒนาวิธีป้องกันรักษาโรค โดยมีรายละเอียดดังนี้

1. ตัวอย่างชุดนี้จัดเก็บโดยทางกระทรวงสาธารณสุข เมื่อวันที่ 13 พ.ค. 2564 ทางกลุ่ม ฯ ได้รับตัวอย่างเมื่อวันที่ 17 พ.ค. 2564 และคดเลือกมา 3ตัวอย่าง (รหัส BKKCCVID720, BKKCOVID721 และ BKKCOVID7 22) เพื่อถอดรหัสพันธุกรรมระดับจีโนม โดยตำแหน่งที่ถอดได้มีลำดับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมตรงกับสายตระกูล B.1.351 ตามระบบ PANGO

2. การถอดรหัสใช้วิธี MinION ของ Oxford Nanopore Technologies โดยมาจากวิธี amplicon sequencing ของ ARTIC Network ผ่านการ

วิเคราะห์โดย workflow ของ COG-UK และระบบ QC ของกลุ่ม ด้วยทรัพยากร Supercomputer จาก ThaiSC TARA

3. Genomic coverage ของ 3 ตัวอย่างอยู่ที่ 85.01%, 90.1196 และ 84.930 %ตามลำดับ ปกติวิธีที่ใช้จะได้ coverage ประมาณ 95-93% แต่ตัวอย่างน่าจะมีการเสื่อมสลายระหว่างขนส่ง เพราะวิธีการอื่นที่ใช้วิเคราะห์ตัวอย่างนี้ก็มีปัญหาคล้ายคลึงกัน อย่างไรก็ดีตำแหน่งที่ได้เพียงพอต่อการกำหนดสายตระกูล ทางทีมถอดรหัสจะใช้วิธีการ ILLumina เพื่อเพิ่ม coverage ของตัวอย่างชุดนี้ต่อไป

4. ทางกลุ่มระนำข้อมูล BKKCOVID721 ที่ได้เข้าสู่ระบบ GISAID และจะรวมเข้าไปใน Nextstrain build รอบถัดไป พร้อมทั้งติดตามต้นตอการ ระบาดด้วยวิธี Maximum -Likeihood และ Bayesian  analyses โดยปกติทางกลุ่มจะนำเสนอข้อมูลให้กระทรวงสาธารณสุขและนำข้อมูลเข้า

GSAD โดยตรง แต่เนื่องจากข้อมูลชุดนี้มีความสำคัญ ทางกลุ่มจึงนำมาแสดงต่อประชาคมวิทยาศาสตร์ทันที

5. เชื้อสายตระกูล  B.1.351 มีการกลายพันธุ์ในตำแหน่งที่คาดว่ามีผลกระทบต่อการตอบสนองของระบบภูมิมกันมนุษย์ต่อไวรัส และลดประสิทธิภาทการทำงานของวัคซีน แต่มิได้แปลว่าวัคซีนจะใช้ไม่ได้  เพียงแต่ต้องเพิ่มอัตราส่วนประชากรผู้ได้รั วัคซีนให้สูงขึ้นเพื่อเกิดการป้องกันระดับประชากร